微基因数据上传到新版Gedmatch~DNALAND～Myheritage 平台的教程 加入gedmatch无法正常使用解决方案

微基因检测结果转入DNA.LAND、MYHERITAGE、GEDMATCH全攻略


众所周知，微基因和国外的知名检测机构23andeme所检测位点的吻合度非常的高，而很多在国际上比较出名的检测平台，都支持23andme格式的原始数据到导入，因此微基因通过格式转换的方式，可以上传到其他平台，对常染分析、寻找亲属等有很大的帮助。

无论上传到什么平台，首先都需要在微基因的官方网站上下载原始核心数据、另外为了转换后的质量能尽可能的兼容所有平台，还需要下载经过微基因计算处理的扩展数据。具体下载方法如下：
在微信端首先设置好自己微基因账户的密码，使用电脑登录和下载数据需要用户密码。密码设置在微基因公众号下点 我的基因----我（右下方）----拉到底设置-----修改密码。如果不知道自己的用户名可以用之前绑定的邮箱登录。如果没有绑定邮箱查看用户名的办法是：我的基因----我（右下方）---上方头像右侧的就是您自己设置的用户名。
下载微基因官方核心数据和扩展数据：首先使用电脑登录微基因官方网站 WWW.WEGENE.COM 然后将鼠标移到网页上探索出，点击原始数据，点击蓝色的点击下载，底下的基因数据就是您的账户下所绑定的所有样本的数据，选择所要下载的样本点击核心数据下载和扩展数据下载。其中核心数据下载V1版本为一个十几兆的txt文件，如果是V2芯片的数据，文件是二十几兆，文件名为样本名，扩展数据需要点击下载后等待一到两分钟计算好后进行下载，文件为zip文件，文件名为编号。
转换成23andme格式文件：
首先需要登录文件转换插件网站 http://joshua.galaxy.42dna.com/wgto23/
WeGene基因数据上传下载好的核心数据 txt文件
WeGene扩展数据选择下载好的zip格式文件的文件
千万不要忘记勾选底下的确认使用扩展数据，否则计算的文件可能不会被Myheritage识别，耐心等待文件的上传和转换文件的生成 ，生成后默认的文件名是sim_23_核心文件的名字.txt

如果您的数据是微基因第二代芯片测出来的（辨认方法为：第二代芯片测试结果核心文件为二十几兆） 请勾选wegene V2版本 转23andme V5版本的对号。这样转换结果为23andme最新格式文件。位点也大大增加。

～～～～～～～～～～～～～～～～～～～～～对于担心上传基因文件转换，会造成隐私泄露的朋友，文章底部提供了相关的单机版本转换器，还包含了魔方或微基因v1版本转23andme的任意版本转换器，以及微基因v2转23andmev5的 专门的单机版转换器。 作者是庄兄。
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下面您就有和23andmeV4或者V5高度相似的原始文件了，可以由此开始肆无忌惮的进行所有兼容23andme格式文件的网站的平台上传。这里主要讲Gedmatch、DNA.LAND、Myheritage三个网站。

Gedmatch

Gedmatch与另外两个网站不同。Gedmatch支持微基因官方出版的原始数据，只要使用微基因的原始数据就可以进行数据的上传。

因为gedmatch进行了系统升级，因此更换了上传和使用网址，以下教程适用于新的网址，使用原网址上传的kit会自动转移到新的网址，用户名和密码没有改变。

该网站部分插件对国内进行了屏蔽，因此登录前需要额外设置 设置方法点以下链接：
Gedmatch无法正常使用的解决方案

步骤一：登录网站 https://genesis.gedmatch.com/

步骤二： Click HERE to register. 点击这里蓝色的HERE进行账号注册（该网站为英文网站，如果大家有英文阅读困难建议使用网络辞典）      注：如果在原gedmatch网站有相关账号密码 直接输入登录即可

步骤三：在网站主页登录账号

步骤四：点击网页中Upload your DNA files - for Genesis BETA ONLY下的第一个Generic Uploads (23andme, FTDNA,AncestryDNA, most others)选项

步骤五：根据其中英文提示填写样本信息，可以只填写姓名 性别 和这个样本的来源。（需要注意的是，这里面有两个yes no的选项。第一个如果不选择yes无法上传，第二个如果不选择yes功能部分限制使用。最后几个选择项根据情况填写，选择前几个的选择项是可以上传的。） 
资料填好，点击选择文件 选取微基因官网下载的核心数据即可，点击Upload。上传之后耐心等待 上传成功后会出现一个Kit Num 这个很重要需要记住。如果不小心没记住也不要紧，账号登录网站后，左下方Your DNA Resources下 左侧是您的kit号 右侧是您输入的样本名。

在上传后，原各地match可以立即查看Admixture (heritage) 下的各种计算器对比。现在要等到Kit has not yet completed matching with other kits状态才能使用该功能。耗时一般在一天之内。其中很多计算器不是很适用于亚洲人，常染计算器是需要横向比较的，其中很多计算器的比较意义并不大，我就不在教程贴赘述了，以后另行开贴讲解。
另外One to one 这种一对一的基因关系对比原网站也是可以立即对比的，可以看看两个KIT号有没有所对应的关系。现在和Admixture功能一样 需要等待大概一天时间。

不能立即查看的是One to many功能。这个就是把你的Kit号和整个数据库内开通对比权限的KIT进行对比，查看常染相关相同的关系，其中用英文描述的非常明白。
这个功能一般在一到两天后可以使用。您可以通过您的kit后所对应的图例，参考网站首页左边KIT栏上方的图例，判断kit的状态，kit上如果有蓝色的对号，就是可以完全使用的状态了。

其实gedmatch还有很多非常有趣的功能，比如说只需要你本人的KIT就可以通过Are your parents related?这里看到您父母是否有基因关系等等 其中的功能基因发烧友们可以自行开发。

另外如果发现自己的KIT 不能进行多人对比可能是出现了权限问题。解决办法很简单，点击左下角的EDIT or DELETE your DNA resource profiles.选择您要编辑的kit右边的SELECT，选择PUBLIC后选择SAVE即可。

DNA.LAND

DNA.LAND需要使用事先准备好的转换成23andme格式的数据，就是那个sim开头的txt文档。
步骤一 登录http://dna.land

步骤二 点击LOG-IN/REGISTER 在左侧注册账号 邮箱 确认邮箱 密码 确认密码

步骤三 在右侧进入登录进去后 点击UPLOAD NEW KIT 如果对协议内容无异议勾选网页底部的对号 点击底下蓝色的 I AGREE：CONTINUE

步骤四 选择上面蓝色的SELECT FILE （注意不是点底下的23andme的图标）选择事先准备好的23andme格式的txt文件

步骤五 填写左侧的 Personal Information 带红色星号的必须输入，看情况勾选底下的三个对号 点击右下角的 PROCEED TO DNA.LAND 耐心等待上传 上传成功后会跳转到其他的页面。
DNA.Land 使用查看方法：登录你的账号后 左侧是显示你账号下的KIT信息，选择相应的KIT，右边的信息意思如下
Name（姓名） Status（状态）
Ancestry Report（祖源报告） view（查看）
Find Relatives （寻找亲属） view（查看）
Find Relatives of Relatives（寻找亲属的亲属） view（查看）
Trait Prediction Report （特征预测） view（查看）

其中祖源报告和寻亲功能等需要等待系统处理的时间不同，都不是可以马上使用的，一般祖源功能的等待时间是一到两天，寻亲功能视情况而定。祖源功能下是有相关的样本采集地的详解的，大家可以仔细阅读，以后会开贴分析DNALAND的常染计算特点，这里不进行赘述了。



Myheritage
和DNA.LAND一样，需要使用事先准备好的转换成23andme格式的数据，就是那个sim开头的txt文档。
 
现在Myheritage网站的祖源分析功能已经开始收费，原上传kit继续不收费，所以说之前上传kit的同志占了便宜。但是寻亲功能可以正常使用。另外，如果你之前上传过你亲属的kit，其实你可以钻个小漏洞，就是上传这个kit后，等两个kit匹配到了基因关系，在之前上传的kit的亲缘关系里寻找新上传的kit，通过成分对比查看新kit的祖源成分。
 
以下是上传操作方法：

步骤一：登录 www.myheritage.com或者www.myheritage.cn

步骤二：点击注册注册账号 拉倒网页最下方 选择点击开始 click to start

步骤三：选填样本信息 点开始启动

步骤四：忽略家谱功能，需要输入自己的相关信息，登录账号

步骤五：点击网页上方DNA 选择 Upload DNA data 点击START 如果是自己的DNA kit，可以选择Mine 如果是别人的 选择Some one else’s 如果没有异议勾选底下的所有对号 别人的样本要填好信息。点击Upload 选择准备好的23andeme文件上传。耐心等待。

和DNALAND相同，其中数据处理需要时间，不会马上出结果。其中所有结果都在DNA选项下，功能和其他平台类似。一到两天后可以查看转换结果。其中也有包括祖源寻亲在内的各种功能。而且这个网站有家谱相关功能，具体大家可以慢慢开发，先不一一讲解，今天有点小累了，我回头重新编辑。




大家如果出结果了，或者有什么问题，可以在帖子下方留言提问，我尽自己所能帮助大家，谢谢各位支持，转载请说明转帖自小可爱老王，再次感谢。



单机版转换器下载

wegene2.0转23andme_V5软件，54万位点完美匹配

wegene2.0与23andme_V5有545337个常染位点重合，但与23andme_V4则仅有30多万个重合。如果用V4上传Dna.land等第三方网站分析，则会浪费20多万个位点，体现不出wegene2.0的优势。
所以，奉献一个wegene2.0转23andme_V5软件，完美支持Dna.land等网站上传。

转换器下载地址 （转化器作者为庄生）
http://res.imtt.qq.com/m_download_qb/qbload_new_1.html

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任意格式转23andme软件 链接：https://pan.baidu.com/s/1nvqIZrrdwm1dr7o5sMe-Rg

作者:庄生


单机版软件比web版本的优势有二：
第一，本软件为单机版，不存在基因数据泄露给非必须第三方的风险。
第二，本软件根据可靠的SNP编号进行筛选，而非相对不可靠的染色体位置信息。
 
V2版本转换站内链接


还没购买微基因产品的小伙伴，这里有微基因标准版/菁英版，减价购买入口，欲购从速：
https://www.wegene.com/shop/?_source=R_120066_68C83D



最后声明:

楼主本人不鼓励大家把自己的原始数据以及如bam文件等相关基因文件传到国外机构（如gedmatch dnaland yfull等），这个行为涉嫌违法，如果是自己的数据的话不会有人追究，但收集他人数据传到国外或鼓动他人上传到国外很可能违反《人类遗传资源管理暂行办法》http://www.most.gov.cn/bszn/new/rlyc/wjxz/200512/t20051226_55327.htm

第二条 本办法所称人类遗传资源是指含有人体基因组、基因及其产物的器官、组织、细胞、血液、制备物、重组脱氧核糖核酸（DNA）构建体等遗传材料及相关的信息资料。
这里包括人类的DNA相关的信息资料。

第四条 国家对重要遗传家系和特定地区遗传资源实行申报登记制度，发现和持有重要遗传家系和特定地区遗传资源的单位或个人，应及时向有关部门报告。未经许可，任何单位和个人不得擅自采集、收集、买卖、出口、出境或以其他形式对外提供。

但是下载自己的数据是完全合法的，而且如果上传到yfull的确对确认下游，寻找父系非常有帮助。楼主对此不阻拦，虽然高通上传yfull很有用，但是楼主明确不鼓励，请自行衡量。

国内的基因网站，比较明确的一点是，给基因助手授权数据是完全合法的，请各位放心。
 
基因助手网址：http://mahui.me/gene/

本帖的开帖目的，是为了给在境外的基因爱好者研究相关数据提供方便教程，你们本人上传自己的数据是不会被追究的，而且的确很有用，尤其是高通上树，但是本人明确不鼓励这种行为，再次声明，明确不鼓励。谢谢各位爱好者的支持。