彝族跟日本在同一代，彝族人是日本人祖先么？

我跟你差不多

在5-6代之前，你的直系祖父祖母有32-64个，假设测得的数据没有误差，而且是纯日本人彝族人和汉族混血的情况，那么在5-6代之前，这32或64个直系祖先里边有一个日本人和一个彝族人，其他30-62个祖先都是汉族人（不考虑其他民族的情况），就会有现在这个结果。那个日本人和彝族人很可能当时根本不认识，而且远隔千里没有联系，比如那个日本人是父系的16-32个祖先中的一个，那个彝族人是母系16-32个祖先中的一个，那么这两个日本人和彝族人直到两百年后你父母认识才产生了联系。
另外很有可能那个日本的成分反应的只是东北的血统，因为东北民族和日本人有共祖的情况，所以可能不是5-6代前家里有日本祖先，可能是4-5代前家里有一位满族人祖先。

你的意思是日本人清朝才出现

你理解错误了，祖源时间线的意思是，告诉你，你的基因中不同人种在哪个时间段加入了你的基因。举例：5-6代，你的母系祖先是彝-日本人混血。
 
  这里的样本也是广义意义上的，平均值样本。

祖源时间线这个功能就是噱头，

纳西的可以看作古羌。
日本的可看做 扶余/渤海这一东北部族的。
日本语和韩语属于阿尔泰语系，和东北少民近亲。
也就是你祖先里有古羌和东北胡人的共组。