wang
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哈佛医学院、德国马普所分子人类学博士后
祖源分析
祖源分析释疑
WeGene飞速发展,在高端大气上档次的道路上越走越远,与此同时,客户对祖源分析的认识水平愈发深入,需求也日益膨胀:能否再细化细化细化???
这里开贴针对客户反复提及的问题整理作答:
1. WeGene的祖源分析参考数据取自哪里?
千人基因组、HGDP和Human Origin项目,根据需要对上述数据进行分类、clean、整合。
2. WeGene的祖源分析能否再细化?
Y染色体和线粒体,我们已涵盖了充足的位点,只要有足够样本能够明确更下游的支系拓扑关系,我们就会马上更新到您的谱系树上;对常染色体,在半年内会新增加一批东亚参考人群数据,包括古代和高度区域化的现代样本,将会给客户提供更细化更准确的祖源构成结果。对欧洲人群,也将马上采用相关古人数据进行祖源分析,解决祖源源流分歧,所用数据来自:
Lazaridis, I., et al. Ancient human genomes suggest three ancestral populations for present-day Europeans. Nature 513, 409-413, (2014).
Jones, E. R., et al. Upper Palaeolithic genomes reveal deep roots of modern Eurasians. Nat Commun. 6, 8912, (2015).
祖源的细化细化再细化在技术上是一件很难的事情,但我们在不断努力!
3. Y染色体和线粒体分型的参考依据?为什么WeGene给出的结果和其他检测机构不一致?
Y染色体ISOGG:http://www.isogg.org/index.html
线粒体:http://www.phylotree.org/tree/index.htm
不一致很可能是由于不同检测机构所使用的分型命名版本不一致,单倍群名称是不断更新的,WeGene按照最新的ISOGG和phylotree版本。
4. 东亚主要Y染色体和线粒体类型的分布和解读?
Y染色体请参考我的论文:http://investigativegenetics.biomedcentral.com/articles/10.1186/2041-2223-4-11
中文版:http://blog.sciencenet.cn/blog-348453-699717.html
线粒体参考:https://www.wegene.com/question/201
5. 为什么韩国人成分这么高?
参考我对韩国人祖源构成的分析:https://www.wegene.com/question/448
6. 为什么家人或同胞的祖源不一致?
答:细微差别算不上不一致,任何模拟都会有合理的偏差,区分高度同质的各汉族群体,5%甚至10%的误差是很正常的;同胞的话,请看下是同性同胞还是异性同胞,因为女性比男性多出一条X染色体,会影响祖源分析;特别注明:WeGene不提供亲缘鉴定,也不会给出亲子关系结论。
7. 为什么我是北方人会有南方成分?我是南方人却有北方成分?
南北方汉族的遗传差异很小,参考:https://www.wegene.com/question/210
人群遗传混合历史是很复杂的,没有人是100%纯粹的南方或北方,即使你这一代或上几代没有混,也不能保证你的无数祖先没有混过。
还有什么问题,提提提!!!
这里开贴针对客户反复提及的问题整理作答:
1. WeGene的祖源分析参考数据取自哪里?
千人基因组、HGDP和Human Origin项目,根据需要对上述数据进行分类、clean、整合。
2. WeGene的祖源分析能否再细化?
Y染色体和线粒体,我们已涵盖了充足的位点,只要有足够样本能够明确更下游的支系拓扑关系,我们就会马上更新到您的谱系树上;对常染色体,在半年内会新增加一批东亚参考人群数据,包括古代和高度区域化的现代样本,将会给客户提供更细化更准确的祖源构成结果。对欧洲人群,也将马上采用相关古人数据进行祖源分析,解决祖源源流分歧,所用数据来自:
Lazaridis, I., et al. Ancient human genomes suggest three ancestral populations for present-day Europeans. Nature 513, 409-413, (2014).
Jones, E. R., et al. Upper Palaeolithic genomes reveal deep roots of modern Eurasians. Nat Commun. 6, 8912, (2015).
祖源的细化细化再细化在技术上是一件很难的事情,但我们在不断努力!
3. Y染色体和线粒体分型的参考依据?为什么WeGene给出的结果和其他检测机构不一致?
Y染色体ISOGG:http://www.isogg.org/index.html
线粒体:http://www.phylotree.org/tree/index.htm
不一致很可能是由于不同检测机构所使用的分型命名版本不一致,单倍群名称是不断更新的,WeGene按照最新的ISOGG和phylotree版本。
4. 东亚主要Y染色体和线粒体类型的分布和解读?
Y染色体请参考我的论文:http://investigativegenetics.biomedcentral.com/articles/10.1186/2041-2223-4-11
中文版:http://blog.sciencenet.cn/blog-348453-699717.html
线粒体参考:https://www.wegene.com/question/201
5. 为什么韩国人成分这么高?
参考我对韩国人祖源构成的分析:https://www.wegene.com/question/448
6. 为什么家人或同胞的祖源不一致?
答:细微差别算不上不一致,任何模拟都会有合理的偏差,区分高度同质的各汉族群体,5%甚至10%的误差是很正常的;同胞的话,请看下是同性同胞还是异性同胞,因为女性比男性多出一条X染色体,会影响祖源分析;特别注明:WeGene不提供亲缘鉴定,也不会给出亲子关系结论。
7. 为什么我是北方人会有南方成分?我是南方人却有北方成分?
南北方汉族的遗传差异很小,参考:https://www.wegene.com/question/210
人群遗传混合历史是很复杂的,没有人是100%纯粹的南方或北方,即使你这一代或上几代没有混,也不能保证你的无数祖先没有混过。
还有什么问题,提提提!!!
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下面是我的原帖子地址:https://www.wegene.com/question/4580
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