xraywu
综合讨论组
大家可以把自己的原始数据上传到GEDmatch和SNPedia进行相应的分析啦~
先简单介绍一下两个网站——
现在,他们都已经支持WeGene原始数据的导入啦!支持WeGene原始数据的导入啦!支持WeGene原始数据的导入啦!重要的事情说三遍。下面我们就来看看如何使用——
GEDmatch.com
SNPedia/Promethease
有兴趣的同学们可以尝试起来啦,有任何问题欢迎报告~
- GEDmatch.com 是一个利用基因组信息进行家系及亲缘分析的网站。用户可以上传自己的基因组数据,与其他用户上传的数据进行比对,分析与他们的亲缘远近及发现未知的家系关系。
- SNPedia 是一个开放的SNP位点维基百科。他们提供了一个叫做Promethease的服务。用户可以上传自己的基因组数据,SNPedia会根据他们已有的信息,分析用户的基因特征,如疾病风险等。每次收费五美元。
现在,他们都已经支持WeGene原始数据的导入啦!支持WeGene原始数据的导入啦!支持WeGene原始数据的导入啦!重要的事情说三遍。下面我们就来看看如何使用——
GEDmatch.com
- 首先在我们的网站上下载你的原始数据:页面右上角点击`设置`-> `隐私` -> `基因数据下载`。输入密码后下载文件。
- 因为目前我们提供的原始数据是纯文本格式的,而GEDmatch只支持压缩文件,你需要先把下载后的数据文件压缩成.zip格式。
- 到 GEDmatch.com 注册一个账号。
- 在网站首页右侧`File Uploads`里选第二项`WeGene upload`。填写一下名字或昵称,选择相应的性别并同意数据进入公共数据库。选择相应的文件并点击`Upload`。
- 上传开始,因为速度较慢,注意不要反复点击按钮。因为他们服务器在国外,如果跳到了页面加载失败的页面再重试。可以挂VPN后上传。
- 上传完成后,会转到一个新页面,不要关闭或刷新页面,等待一段时间以后,页面上会显示一个标红的ID(如M000000)。这份数据就上传完成啦。回到首页,你会发现在左下角`Your DNA Resources`里出现了该ID。
- 隔一段时间以后(通常是数小时),可以点击`Analyze Your Data`里的`One-to-many matches`工具查询你的数据与其他用户数据的远近。在打开的页面里输入你的数据ID,选择要用常染色体还是X染色体数据分析,点击`Display`即可看到结果。结果里会给出亲缘关系较近的用户,其中`Gen`一列显示你和他们之间隔了大约几代。
SNPedia/Promethease
- 与GEDmatch一样,下载你的原始数据,无需压缩。
- 去到Promethease首页,点击其中的`Upload Raw Data`上传文件(较慢,同样建议VPN)。
- 上传完成后,点击`Purchase for $5`,输入一个有效的邮箱地址,然后付钱,支持支付宝哦。
- 付费完成后,数据就会开始分析。等一段时间后,可以在邮箱收到报告到Promethease网站查看。也可以在网站上下载。数据在网站上保留45天。
- 报告上主要会根据上传的基因组数据判断你的健康风险。
有兴趣的同学们可以尝试起来啦,有任何问题欢迎报告~
45 个回复
赞同来自: tszhrzkc 、hiorus 、Boris05 、leetoury 、Orion_yin 、stephenwang 、反射弧长长不打紧更多 »
赞同来自: xraywu 、AMD_Yes 、甘棠夭夭 、mali2002 、加里dna 、huaiyi更多 »
是基因检测数据有质量问题?
来自页面https://www.snpedia.com/index.php/Testing
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文件名称必须包含一个名称、一个点,GED紧随其后
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怎么肥四?
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(197) ERROR: File type = ZIP
File name must consist of a name, a dot, followed by GED
我看不懂英文
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WeGene is not supported
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