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【基因助手】2025年清明时节更新,支持 David Reich 的AADR古人DNA,1240k高通量测序,共17629个古人+现代人

哈佛大学的 David Reich 实验室发布的Allen Ancient DNA Resource (AADR) 是目前比较全面的古人DNA数据,目前最新版本是v62。Reich团队对全球公开发布的古人类样本(全部采用shotgun测序和溶液内靶点捕获技术,使用1240K探针捕获分型)的原始数据BAM或FASTQ进行重新分析,并基于YFull单倍群树分析了古人类的父系和母系。目前共有 17629 个样本,其中包含 13571 个古人和 4058 个现代人。
Growth_in_world’s_published_human_genome-wide_ancient_DNA_data.png


基因助手本次升级:
1,引入AADR v62全部 17629 个样本数据。
2,在“古人基因”(https://geneu.xyz/ancient) ,可按Y或mt单倍群、国家、族群搜索古人,例如:在族群输入Xinjiang,显示所有中国新疆古人;输入Yamnaya,显示所有颜那亚古人;输入Viking,显示所有维京古人;输入BellBeaker,显示所有欧洲钟杯文化古人;输入CordedWare,显示所有欧洲绳纹器文化古人;输入Maikop,显示所有迈科普文化古人;输入Sintashta,显示所有辛塔什塔文化古人;输入Afanasievo,显示所有阿凡纳谢沃文化古人;输入Scythian,显示所有斯基泰古人;输入Mayan,显示所有玛雅古人。。。输入不区分大小写
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3,点击“古人名称”,显示古人详情信息,同时显示古人的Y或mt单倍群的地理分布。
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4,在“单倍群搜索”(https://geneu.xyz/haplo-query),对于YFull单倍群,可在YFull树上显示古人(和YFull样本、名人并列显示)、显示YFull单倍群下所有古人的地理分布(可选是否包含下游单倍群)
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基因助手古人基因入口:https://geneu.xyz/ancient
2025-04-04 • IP属地新加坡
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1 个回复

哈佛有检测中国古人吗

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