Mehmet
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综合讨论组
【基因助手】2021除夕夜给微基因祖源爱好者的礼物,美国 FamilyTreeDNA 父系和母系树!
http://geneu.xyz
为了给微基因的祖源爱好者更多信息参考,本次加入了美国 FamilyTreeDNA 基因公司的树形,也同样保持实时更新!
目前支持 微基因、YFULL、FamilyTreeDNA 、ISOGG(和磨房高度一致)四家国内外公司的父系和母系树,并保持实时更新,树形展示可自适应手机移动端和PC端,在手机移动端显示查询单倍群下游所有节点和姓氏统计。在PC端显示从根节点(亚当夏娃)延伸到所查询的单倍群节点和姓氏统计,并可以继续往下展开浏览下游单倍群,树形图可以滚动鼠标放大缩小、平移,方便浏览。以上的各家树形,都可以通过基因助手的单倍群查询功能进入,搜索时输入YCC命名或SNP命名都可以(比如R1b1a1a2或M269,两者等价,不区分大小写字母),查询结果显示了模糊搜索的单倍群列表,不同颜色(蓝色、黄色、红色、橙色)表示属于不同基因公司的父系或母系树,点击小图标即可进入查看树形、样本地理分布。
注意,各家的父系母系树,树上单倍群的Y-SNP命名都是统一的,比如R-M269在各家都是指的同一个单倍群,但他对应的YCC命名则可能各个版本不一样,比如微基因使用的YCC 2018版本中R-M269是R1b1a1a2,但在最新的YCC 2019版本中则是R1b1a1b,所以最好用Y-SNP命名R-M269来看各家的单倍群树,确保一致性。另外各家的树形结构也会略有区别,这是由于各家拥有的样本不同,Y分型结果不同导致树形不同,或者参考的ISOGG树形版本不同导致的树形差异。
一键查询多家基因公司的父系母系单倍群树,树形和样本统计,与各家基因公司保持实时同步。
自适应PC和手机端,树显示在手机端是竖向风格,在PC端是横向风格,也可以手动切换风格,方便浏览
微基因Y父系树,手机端竖向风格
微基因Y父系树,PC端横向风格
微基因Mt 母系树,PC端横向风格
ISOGG Y树(与磨房高度一致),PC端横向风格
R-Z2106 YFULL样本的地理分布
O-M268 微基因样本的地理分布
给微基因或YFULL用户发送站内信,微基因或YFULL会同时转发邮件通知对方
另外首页菜单最后增加了几个外国名人Mt母系 ,列出了沃伦巴菲特(Warren Baffett)、约旦Noor女王、“欧洲女皇”玛丽娅·特蕾莎(Maria Theresa)、法兰西的伊丽莎白(anne of bohemia and hungary),可见欧洲人母系基本都是H分支,以后会再增加更多名人父系母系。
预告,基因助手下次升级将在2021年新年,包括Y分型、祖源计算器,都将提供。区别于大家目前常用的同类工具,将在参照标杆数据上做到实时更新,优化算法,确保Y分型和祖源结果更准确。
为了给微基因的祖源爱好者更多信息参考,本次加入了美国 FamilyTreeDNA 基因公司的树形,也同样保持实时更新!
目前支持 微基因、YFULL、FamilyTreeDNA 、ISOGG(和磨房高度一致)四家国内外公司的父系和母系树,并保持实时更新,树形展示可自适应手机移动端和PC端,在手机移动端显示查询单倍群下游所有节点和姓氏统计。在PC端显示从根节点(亚当夏娃)延伸到所查询的单倍群节点和姓氏统计,并可以继续往下展开浏览下游单倍群,树形图可以滚动鼠标放大缩小、平移,方便浏览。以上的各家树形,都可以通过基因助手的单倍群查询功能进入,搜索时输入YCC命名或SNP命名都可以(比如R1b1a1a2或M269,两者等价,不区分大小写字母),查询结果显示了模糊搜索的单倍群列表,不同颜色(蓝色、黄色、红色、橙色)表示属于不同基因公司的父系或母系树,点击小图标即可进入查看树形、样本地理分布。
- 对于微基因树,树上的单倍群节点如 R1b1a1a2a2c 是YCC 2018版命名规范,对应的代表SNP(Z2106)、共祖时间、样本姓氏统计也会显示出来,其他功能如浏览地图样本分布、发私信等与原功能一致。
- 对于FamilyTreeDNA树,树上的单倍群全部采用Y-SNP命名法,每个单倍群提供SNP信息,以及属于这个单倍群的人群国家分布,点击定位小图标可以看到世界地图的样本分布。FTDNA公司的数据量目前应该是全球最多的,目前公开的父系和母系数据分别有20万人左右。
- 对于YFULL树,提供了在世界地图上浏览某个单倍群下游所有样本功能,如有YFULL账号还可发私信,YFULL树形图功能完善,所以基因助手不再重复展示树,而是链接到YFULL的树页面。注意YFULL树上都是高通样本,因此有很多新发现的私有SNP位点形成的单倍群分支,这和国内基因公司的树形略有区别。
- 对于ISOGG树(和磨房高度一致),展示树型和单倍群的共祖时间,不提供样本查看。注意他的Y树包含高通单倍群节点,树上的单倍群节点如 R-Z2106 是Y-SNP命名规范,Z2106是这个单倍群的代表SNP,可以和微基因树或YFULL树通用。对于在这家公司做过Y高通的人,会看到树上有自己私有SNP点位形成的Y单倍群节点,这种高通确认的单倍群节点的共祖时间会标记为60~xxxx年。
注意,各家的父系母系树,树上单倍群的Y-SNP命名都是统一的,比如R-M269在各家都是指的同一个单倍群,但他对应的YCC命名则可能各个版本不一样,比如微基因使用的YCC 2018版本中R-M269是R1b1a1a2,但在最新的YCC 2019版本中则是R1b1a1b,所以最好用Y-SNP命名R-M269来看各家的单倍群树,确保一致性。另外各家的树形结构也会略有区别,这是由于各家拥有的样本不同,Y分型结果不同导致树形不同,或者参考的ISOGG树形版本不同导致的树形差异。
一键查询多家基因公司的父系母系单倍群树,树形和样本统计,与各家基因公司保持实时同步。
自适应PC和手机端,树显示在手机端是竖向风格,在PC端是横向风格,也可以手动切换风格,方便浏览
微基因Y父系树,手机端竖向风格
微基因Y父系树,PC端横向风格
微基因Mt 母系树,PC端横向风格
ISOGG Y树(与磨房高度一致),PC端横向风格
R-Z2106 YFULL样本的地理分布
O-M268 微基因样本的地理分布
给微基因或YFULL用户发送站内信,微基因或YFULL会同时转发邮件通知对方
另外首页菜单最后增加了几个外国名人Mt母系 ,列出了沃伦巴菲特(Warren Baffett)、约旦Noor女王、“欧洲女皇”玛丽娅·特蕾莎(Maria Theresa)、法兰西的伊丽莎白(anne of bohemia and hungary),可见欧洲人母系基本都是H分支,以后会再增加更多名人父系母系。
预告,基因助手下次升级将在2021年新年,包括Y分型、祖源计算器,都将提供。区别于大家目前常用的同类工具,将在参照标杆数据上做到实时更新,优化算法,确保Y分型和祖源结果更准确。
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赞同来自: 为什么小姐
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