havefun
综合讨论组
有人看了WEGENE最新出的论文吗?
由于是英文版,我英语不大好。
为什么这图2的CD两张图会不一样。
The most populated 1st-level (a), 2nd-level (b), and 3rd-level (c) cluster in each prefecture. d. The 3rd-level cluster with the largest odds ratio in each prefecture. e. The spatial distribution of the 3rd-level subclusters in Jiangsu province is accompanying the linguistic-cultural division. The most populated clusters were shown. f. Three major clans in Guangdong, Canton, Hakka (falling into two clusters), and Min-Chaoshan, can be distinguished from the haplotype network clusters. The clusters with the largest odds ratio were shown. g-h. The paths of the Zou Xikou (g) and Chuang Guandong (h) migration waves. In panels a-d, 50% transparency was applied to the prefectures with small sample sizes (n < 10), and prefectures with no valid samples were left blank.
按论文描述图C应该是以“三级”分类prefecture我理解为地级市,占比最大的做的图。
可是图D确在细节处有很大的不同,比如胶东地区,福建。
在二级分类的情况下,赣州汉与东南的闽客浙南一组,但继续细分,三级下赣州和中南组归为一类图C,但图D又归入珠江流域的客家组。
还没完,继续细分,四级分类下,赣州与梅州龙岩汕尾聚成一组,脱离珠江流域的客家组。
还有论文给出了闽粤三个族群与二级下的北方组的关系,却没有给出闽粤与华中和华东和西南组的关系。我想知道邻近的中南组合和二级下的华北组IBDshareing能透露一下吗。
有微基因的大佬知道原因吗?
8 个回复
从图上看,赣州这个地方最大的组团依然应该是两湖江西的主力(在江西是江右民系),而最具代表性的组团却是(疑似)客家。类似地在广东,在广、客、潮交接的地方,也会出现「最大」与「最具特点」的组团不同的情况
用odds ratio有时候可以看到更精细的地域分布特点,比如胶东半岛和东北共享同一个最具代表性的组团,可能暗示了「闯关东」移民(尤其是经水路的移民)和闯关东出发点——胶东半岛的近代遗传关联
赞同来自: 大灰狼 、havefun 、zhengqiang 、yanc 、WeChat_043D99
论文doi: https://doi.org/10.1101/2020.07.03.166413
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