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xiaofeng281949 xiaofeng281949 父系单倍群N

【请教大神】看到一份最新的关于单倍群N分类的研究报告，值得参考，但是不知道怎么用于分析自己的数据并归类

文章来源 https://arxiv.org/abs/1504.06463
 
似乎介绍了一种全新的N单倍群分类的方式。然而这里有很多SNP不知道WeGene里是不是有分析到，是否可以用来判断自己在新的分类体系里属于多少。只有请教大神啦!!
2016-10-06 • IP属地中国
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10 个回复

wang - 哈佛医学院、德国马普所分子人类学博士后
我是这篇论文的作者之一
 
WeGene芯片涵盖了论文中提到的SNP，你只需要到自己的祖源结果页面，点击beta树，看上面的突变位点情况即可。

赞同来自: 蓝星旗 、xiaofeng281949 、xraywu

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2016-10-06 • IP属地德国 • 评论 (0)
xiaofeng281949
wegene藏龙卧虎啊，哈哈。

谢谢@wang的答复。我的问题在于我好像无法根据那篇文章里的分类方法把我归类。不知道是不是我弄错了。贴上我的突变位点。请指教一下吧。
 

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2016-10-06 • IP属地中国 • 评论 (0)
wang - 哈佛医学院、德国马普所分子人类学博士后
你是P43+啊，因为论文中没有检测L665这个位点，所以你在Figure Legend中找不到自己L665+的分类。

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2016-10-06 • IP属地德国 • 评论 (0)
xiaofeng281949
噢， 看起来我只有M231和P43两个位点match。科室貌似从M231到P43之间还有两个位点我是没有的，是不是？F1206, F2130, F3094, F3312, F3361, F3163, F3665, 这些我都没有啊。

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2016-10-06 • IP属地中国 • 评论 (0)
wang - 哈佛医学院、德国马普所分子人类学博士后
注意：WeGene展示的beta树是根据现有ISOGG的树http://isogg.org/tree/ISOGG_HapgrpN.html来画的拓扑结构，而genotype的位点却多于现有ISOGG的N树，所以没有展示出的位点就要去你的原始数据里去查找了。

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2016-10-06 • IP属地德国 • 评论 (0)
xiaofeng281949
嗯，嗯， 了解，谢谢@wang. 我现在的原始数据还没有出来。还不知道怎么在原始数据里找位点，有没有什么攻略介绍我可以先研究研究的呢？
 
另外，我查阅了一些资料，N单倍群大概是在公元前4000年的时候逐渐被O单倍群取代成为东北亚的优势族群。有没有可能所谓涿鹿之战就发生在古老的N单倍群和O单倍群之间？然后这场战争酝酿出了龙山文化？

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2016-10-06 • IP属地中国 • 评论 (0)
wang - 哈佛医学院、德国马普所分子人类学博士后
不清楚N和O与逐鹿之战的关系

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2016-10-06 • IP属地德国 • 评论 (0)
xiaofeng281949
我是瞎猜的啦。。
 
我现在的原始数据还没有出来。还不知道怎么在原始数据里找位点，有没有什么攻略介绍我可以先研究研究的呢？

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2016-10-06 • IP属地中国 • 评论 (4)
xiaofeng281949
@wang, 我的最终数据出来了。在数据里找到了匹配的SNP如下：
 
Common N:
M231
M232
F2636
F3373
F963
F2999
 
N2:
F2952
F2930

N2b:
F2569

P43 ？？
 
按照这里的描述，大概属于N2b。不过奇怪的是我也有P43这个SNP。是不是N2的分类还可以再细化？谢谢.
 
PS: 按照这里的分法，应该我属于N F4201。

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2016-10-17 • IP属地中国 • 评论 (0)
wy198401
我只有F3665+ f1774+ f2729+ v2047+。

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2019-08-29 • IP属地大连 • 评论 (0)

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