大笑的AJAP1基因 综合讨论组

RS74653330的基因型是CT还是AT?

在查询RS74653330时wegene的标注,该RSID的基因型是C或T。 但别的地方看到关于这个RSID的一段说明是这样的: “OCA2 481 Thr的snp名称是rs74653330,北亚族群肤色浅化的决定性基因。23andme测过有密码书的同学,自己查一下,AA肤色最前,与北亚相关性最强,TT肤色较深,AT居中。汉族A频度约10%。” 我的查询结果是CC, 既不是A也不是T,这该怎么解释呢?多谢!
2016-09-18 • IP属地上海
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4 个回复

正负链的转换是
 A <-> T
C <-> G
你好,这个位点上正链是C/T,负链对应的是A/G。从我们在自己的23andme数据上查询,同样是C/T的基因型。
 
参考链接:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/SNP/snp_ref.cgi?searchType=adhoc_search&type=rs&rs=rs74653330 
https://www.snpedia.com/index.php/Rs74653330
 
我们并没有查到有A/T 基因型的出处
@xraywu 谢谢回复。是在网上看见的,请见附件。问这个问题的原因是,遇到好几次有人讲RSID,AGCT四个碱基的表现时,发现正好完全不是从wegene找出的自己基因型,get confused。

还想请教,例如:RS74653330, 如果解释说AA的肤色最浅这个解释本身没问题他说的是负链,而我在这个位置上是CC,那么我应该忽略这个信息对肤色的意义,还是说有对照关系,比如A对应C或者T这样来看呢?多谢。

rsid.png

 
safin - MtDNA-D2
我也是CC,我算很白

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