Y染色体是人的性染色体之一，用于决定男性性别，一般情况下只有男性才有Y染色体，并且只能由父亲传递给儿子。Y染色体一般不发生同源重组，因此儿子会继承几乎与父亲完全相同的的Y染色体。 由于DNA复制过程中可能有一定几率发生错误，每次遗传信息传递过程中， Y 染色体上会产生约2个突变。这样的突变在人类族群的数万年的演化历史中会被积累下来，被分子人类学家用于推演族群的演化历史，我们称之为父系祖源。

有研究表明，现代智人最早是从非洲出现的。根据父系祖源推算的所有男性的最近共同祖先（the most recent common ancestor），也就是Y染色体亚当（Y-chromosomal Adam ）出现在距今大约236000年前（一说275000年）的非洲，而欧亚大陆的男性最近共同祖先大约可以追溯到69000年前。

根据不同族群的Y染色体数据，分子人类学家建立了树状的Y染色体单倍群图谱，这个树上每一个节点都对应了一个单倍群，用于代表有相似突变的Y染色体。WeGene通过用户的检测结果和参考的Y染色体单倍群树结构的比较，可以准确预测其Y染色体单倍群，从而追溯父系祖源的起源、演化和迁徙历史。

WeGene 使用了自主开发的Y染色体单倍群分型方法，可以快速准确地预测用户的Y染色体单倍群。该方法参考了ISOGG公布的Y染色体单倍群树，通过比较用户的Y染色体检测结果，对树上的每一个单倍群都进行了可能性评分，得分最高的单倍群将会被认为是用户的最佳匹配单倍型。经过对评分系统的不断优化，WeGene现在提供非常高准确性的Y染色体单倍群分型结果，并提供了ISOGG参考树上所有检测位点匹配情况，便于比较查阅。

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• International Society of Genetic Genealogy (2018). Y-DNA Haplogroup Tree 2018, Version: 13.19, Date: 21 January 2018. http://www.isogg.org/tree/ 21 January 2018.

• 2018.5 - 更新到了 ISOGG 2018 版单倍群树
• 2016.12 - 部分单倍群信息校正